Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcc1P97496 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms