Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Usp9xP70398 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Usp9xP70398 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Usp9xP70398 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Usp9xP70398 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Usp9xP70398 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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