Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SrprbP47758 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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SrprbP47758 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SrprbP47758 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SrprbP47758 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SrprbP47758 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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