Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ggta1P23336 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms