Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NelfeP19426 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms