Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Sdc1P18828 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Sdc1P18828 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms