Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cited2O35740 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms