Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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H2-M1F7CXU4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M1F7CXU4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
H2-M1F7CXU4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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H2-M1F7CXU4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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