Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cspp1B2RX88 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms