Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Usf3B2RUQ2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Usf3B2RUQ2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Usf3B2RUQ2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usf3B2RUQ2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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