Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf1B2RRD7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms