Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cldn8Q9Z260 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms