Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim44Q9QXA7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim44Q9QXA7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim44Q9QXA7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trim44Q9QXA7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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