Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf128Q9D304 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf128Q9D304 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms