Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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