Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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