Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ergic3Q9CQE7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms