Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nsmce3Q9CPR8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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