Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Gm9955Q8CEJ8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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