Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Arhgef17Q80U35 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Arhgef17Q80U35 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Arhgef17Q80U35 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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