Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smchd1Q6P5D8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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