Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Irf4Q64287 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms