Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
H2al1nQ497L1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms