Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q3U1D9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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