Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SIX1Q15475 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SIX1Q15475 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SIX1Q15475 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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SIX1Q15475 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SIX1Q15475 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX1Q15475 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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