Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Perm1Q149B8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms