Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
StumQ0VBF8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
StumQ0VBF8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
StumQ0VBF8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
StumQ0VBF8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
StumQ0VBF8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
StumQ0VBF8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
StumQ0VBF8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
StumQ0VBF8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
StumQ0VBF8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms