Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Thbs3Q05895 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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