Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SagP20443 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SagP20443 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SagP20443 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms