Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ascl4M0QW46 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms