Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Zfp870J3QMA4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms