Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm21818J3KMS6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21818J3KMS6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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