Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn6Q9Z262 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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