Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CYI0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q9CYI0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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