Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Cxxc1Q9CWW7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms