Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PompQ9CQT5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PompQ9CQT5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PompQ9CQT5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PompQ9CQT5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms