Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klc3Q91W40 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.6 ms