Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Dkk4Q8VEJ3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms