Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4M5

Commd1, COMM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd1Q8K4M5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Commd1Q8K4M5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Commd1Q8K4M5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms