Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms