Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ss18l1Q8BW22 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l1Q8BW22 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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