Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pggt1bQ8BUY9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms