Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp3Q3ULW8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms