Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ulk3Q3U3Q1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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