Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rundc1Q0VDN7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms