Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Shisal1Q0VBP7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms