Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Mmp9P41245 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Mmp9P41245 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Mmp9P41245 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Mmp9P41245 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Mmp9P41245 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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