Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Upk2P38575 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms