Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acvr1P37172 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms