Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrkchP23298 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkchP23298 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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